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且不提广东两个朝廷风风火火准备一决生死之时，孟浚在各地转了一圈后，又回到了苏州城内，一到苏州城，孟浚便召集众人进行商议。
而整个九月份以来，对孟浚来说，几乎是忙的透不过气的一个月，所谓百废待兴就是形容孟浚此刻的现状，虽然军事上没有那么急切，清廷目前被其余几处战场拖住了手脚，但是可以预见的是，大规模的战争不会遥远，不是孟浚率先进攻以图破局，便是清军再起大军围攻孟氏。
在九月上旬，孟军诸镇便已补员完成，孟浚随即令林士奇所部之克武镇收复孟浚故乡常熟，同时武宁武兴二镇进攻无锡，威胁常州镇江，孟浚此意为试探清廷。
忙忙碌碌了一阵，孟浚刚躺在背椅上休息一会，这时俞安便走了进来道：“都督，宣传司吴司长求见”
“吴台？”孟浚一拍脑瓜，事太多了，自从回到苏州城都还没见到吴台，随即对俞安说道：“去，快请进来”
吴台，是跟随孟浚的老人了，虽然其能力一般，却也是和杨恩同时追随孟浚，那时的孟浚兵不过千人，无立足之地，更是难能可贵。
吴台身着一袭青布长衫，身姿挺拔，儒雅的气质中透着几分刚毅，一见到孟浚，吴台便躬身行礼道：“属下参见都督”
“应人（吴台字）快快请起！”孟浚急忙说道，并伸手将吴台扶起。
吴台起身后，毕恭毕敬地从怀中掏出一份早已准备好的文档，呈递到孟浚面前，然后开口说道：“都督大人，这是宣传司下半年的相关计划和安排，请都督过目一下，如果有什么不完善或者需要改进的地方，请都督明示。”
孟浚接过文档，仔细翻阅起来。看着看着，他的眉头逐渐皱起，过了许久，孟浚才抬起头来，看着吴台说：“宣传司有些过于保守了，你们只打算前往杭州，绍兴，宁波等几个大城市进行宣传鼓动，但却完全忽视了广袤的乡镇地区，我要让所有人都知道抗清，绝不是与他们毫无相关之事，我要让所有百姓感同身受。”
孟浚说完顿了一下，喝了口水，又接着说道：“此外，宣传司可以考虑派遣一些精明强干之人深入清廷控制区域，暗中宣传，策划并组织各种形式的反清活动，以动摇其统治根基，扰乱他们的社会秩序”
吴台听闻此言，脸色微微一红，额头上甚至冒出了些许细汗。他下意识地伸手擦拭了一下，他略带愧色地说道：“真是惭愧，还请都督见谅，属下这就回去重新安排。”说罢，转身欲走。
然而，孟浚却抬手拦住了吴台，脸上露出一丝笑容，安慰道：“应人，勿急，也是都督府支持不足所致。这样吧，你先回去重新写个条例，再统计一下大概需要多少人手和钱粮，然后报上来，都督府尽力补足。”
吴台听后，心中稍感宽慰，连连点头表示感谢。接着，他再次向孟浚行了一礼，然后才缓缓转身离开。
孟浚看着吴台离去后，有些疲惫的坐在椅子上，都督府虽然早已成立，却其实一切为了军队而服务的，这显然是畸形，孟浚早就有想过改制都督府，却没能抽出时间来，想到此孟浚强打精神。
在孟浚的设想中，都督府组织架构，上设参赞部，下设吏政司，民政司，军政司，宣传司，律政司，匠作司，几乎是大明朝内阁和吏户兵工礼五部的变种。
而仅靠孟浚自己想要完成都督府编制，实在是太过繁琐，想到此，孟浚对着门外的俞安喊道：“去请慕德，顾先生，还有张博他们都请来”
“是都督”随后一阵急促的脚步声由近及远。
随着杨恩和顾炎武诸人急匆匆的赶来，孟浚先是让人倒了几杯茶，道：“先喝口茶”
喝了口茶，杨恩率先开口道：“都督，不知有何急事”
“我深思熟虑后决定对都督府进行体制改革，原先所有一切都是围绕着军队展开的，但现在情况已然不同。我们如今坐拥如此广阔的领地，已不再是那个只有苏州一城之地的时期了。当前面临诸多问题，如税收、官吏治理、法律法规、海外贸易、钱粮分配等重要事务都缺乏明确的负责人来管理，如果没有规章制度，那必然会陷入混乱。”孟浚目光注视着眼前的几个人，郑重其事地说道。
杨恩听后，表示赞同地点点头，回应道：“确实如此。”他深知规范管理对于一个势力的重要性。
顾炎武闻言开口道：“都督，何不如以朝廷旧例，若是改之，我怕人心浮动”
张博听到顾炎武的话，表示反对，摇摇头道：“朝廷旧例，怎么改，总不能也弄兵部户部吧”
“倒不是这个意思，我的意思是都督府改制可，不变地方之制，若变，一方面必要宵小置疑都督之心，第二也怕地方百姓不安”顾炎武缓缓的说道。
在场的每个人都开始各抒己见，畅所欲言地参与到这场热烈的讨论之中，有时会因为意见不合而争论得面红耳赤，但更多的时候则是在互相探讨，就这样，时间一分一秒过去了，整整一天过去了，然而众人却浑然不觉，直到入夜，都督府新制方才出炉。
都督府作为一个庞大而复杂的机构，其内部设有多个部门以实现全面管理。其中最重要的当属参赞部了，它犹如都督府的大脑一般起着关键性作用，如大明朝廷的内阁一般。
参赞部下辖有五个司职部门：首先是吏政司，这个部门负责管理官员们的职务升迁与降职等事宜，可以说是各司之首，其次是民政司，其职权范围广泛，包括钱粮的征收、物资的调配供给等事务，接下来是军政司，所有军事行动都必须经过该司的批准才能实施，同时他们还掌管着各地驻军以及各镇步兵和水军，宣传司，顾名思义这是一个专门负责宣传工作的部门，最后还有律政司，主要任务是监督检查各级官僚并处理相关法律事务，至于匠作司，则专注于武器装备的制造生产。