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这巫族夸父、后羿之死和妖族九太子之死令两族的矛盾进一步恶化，两边更是怒火冲天，巫族的好战之士十二祖巫之共工和玄冥、烛九阴还有祝融听说后，几次招集大巫准备发动大战，都被后土和帝江阻挡下来。
这年，千年之期终于过了，巫族十二大祖巫经过几次协商后终于达成一致意见，点齐所有巫族精锐之师一共80余万浩浩荡荡开往不周山，势要一举消灭妖族。妖族帝俊和太一也迫不及待，招集所有天妖诸神60余万，再招来东海龙族精锐30万，凤凰族30余万，共计120万大军下得天庭，在不周山外数十里扎寨迎接巫族的到来，女娲既然答应要暗中帮助帝俊太一，于是和伏羲商量后，由伏羲出面帮忙，伏羲和女娲一起得道，道行和帝俊太一差不多，更有先天法宝伏羲琴在手，厉害非常。
不周山红云圣人演算天机知道巫妖大战即将战到不周山处，本想去劝战，可师父鸿钧不让圣人插手巫妖大战，于是唤来所有灵教弟子，一起搬家，给巫妖挪出一个舞台，让他们尽情表现。
逍遥子也算到巫妖大战起，于是吩咐三个弟子随他一起前往观看，以提深道行。但只让陆压在海市蜃楼闭关修炼，怕他见父亲大战而出手帮忙，送了小命。
三清的三个圣人也在昆仑山玉虚宫开了天眼，观摩这一场大战，西方准提和接引两个圣人那能错过这等好戏，也前往观看。
就这样，巫妖大战在诸位洪荒名人关注下展开了。
这日，不周山以北浓烟滚滚，沙尘飞扬，天色灰暗，无数洪荒生灵四处逃散，眼前一行巫族大军浩浩荡荡开来，最前面十来位大将一字排开，最左边乃是十二祖巫之帝江，帝江面露正气，好一股威严，不可战胜之雄霸气势，浑身冒有火红光芒，赤如丹火，六足四翼，浑敦无面目，吓人于胆破，乃时间之祖巫。
左边第二位，乃十二祖巫之东方句芒，鸟身人面，乘两龙。表情木钠，威武气势，也是霸气蔓延，实乃木之祖巫。
第三位，乃十二祖巫之西方蓐收，左耳有蛇，乘两龙。身上泛着金光，乃金之祖巫。
第四位，乃十二祖巫之共工，铁头虎脑，凶悍非凡，周身彪撼，乃水之祖巫。
第五位，乃十二祖巫之南方祝融，兽身人面，乘两龙，周身火焰包围，乃火之祖巫。
第六位，乃十二祖巫之烛九阴，烛九阴长期居住在西北海之外，赤水之北章尾山上。称神，人面蛇身而赤，直目正乘，其瞑乃晦，其视乃明，不食不寝不息，风雨是谒。是为烛九阴，又称烛龙，乃时间之祖巫。
右边第一位，乃十二祖巫之良强，只见他嘴里衔蛇，手中握蛇。虎头人身，四蹄足，长手肘，手中轰鸣之声，乃雷之祖巫。
右边第二位，乃十二祖巫之奢比尸，这人奢比有尸，人面、犬耳身，珥两青蛇，名曰奢比尸，能呼风唤雨，乃称天气之祖巫。
右边第三位，乃十二祖巫之天吴，生于朝阳之谷，神曰天吴，是为水伯，呼啸发风而不动，是称风之祖巫。
右边第四位，乃十二祖巫之翕兹，此巫天生法力高强，浑身闪电聚集，掌握电之使用，称为电之祖巫。
右边最后一位，便是十二祖巫之后土，因为他年岁最小，所以派在最边上，本事却不小，翻手盖天，缚手去土，称土之祖巫。
十二祖巫齐聚，宝贝无数，却无甚厉害东西。十二人身后还有刑天，其余若干知名大巫，这里就不一一点名了。
而对面也有数大队妖族人马，比起巫族人数只多不少，正面看来，前面乃三大妖师，左边乃女娲之兄伏羲是也，只见伏羲端坐赤金大鸟身上，手持先天灵宝伏羲琴，偶尔拨动琴弦，铮铮作响，震得旁人耳朵生疼。
中间乃天庭之主，天帝帝俊是也，只见他负手立于天际，高昂着头，一副君临天下的霸气使人顿生威严之感，手中宝贝河洛图书，散发宝光。
右边也乃天庭之主，东皇太一是也，但见他眉头紧皱，身手潇洒自如，手持四大先天至宝之东皇钟，泛起灵动宝光。
三人身后，乃东海龙族龙霸是也，只见他面露凶光，脸颊上青紫龙鳞一闪一闪，甚是吓人。
还有凤凰族的凤枭，凤枭这时并未显出凤凰真身，只见他穿着豪华典雅，实有凤凰族最美之称，别看他文质彬彬，化出真身后，欲火重生之术烧得人心头发毛。
随后又有鲲鹏，毕方，鲲鹏精于变化，通灵万物，鱼身鸟身混合，气势非凡。毕方，长年居住在章峨之山，属鸟，型状如鹤，一足，有红色的纹和白喙。道行不浅。
后面还有十大妖圣，分别是计蒙、英召、飞廉、九婴、商羊、钦原、白泽、胡方、穷奇、诸犍，这里不一一点名了。
两军对阵，声势浩大，只见巫族旗帜一扬，两军开始撕杀起来，冲天的呐喊声震的洪荒大地一抖一抖的，这接近两百万的有法力的军队战斗起来，那破坏力可谓史无前例，那景象可是从来没人见过的。战斗中的大将还有不少去鸿钧的紫霄宫听过道，那法力可说铺天盖地，风卷残云。一阵又一阵的神通席卷，仿佛到了世界末日。吓得不少法力低一些的族内连连后退，说不定被一阵妖风吹过就化为灰灰，死得不明不白。还有不少不远居住的人族被央及，死伤不少。
诸神之战，当然也是兵对兵，将对将，说那天帝帝俊，使出法宝河洛图书，以一敌三祖巫，虽然吃力，却也不落下风。东皇太一，却靠着厉害法宝东皇钟，以一敌四，战得风生水起。龙霸、凤枭、鲲鹏、毕方也是准圣地位，各自对付一个祖巫，伏羲却是对付十二祖巫中最为厉害的帝江，伏羲乃与女娲一起修道，又有法宝伏羲琴在身，自然越斗越勇，那后土部的后生刑天法力不弱于是上前助阵。那家伙可厉害了，下面更是乱砍一大片。
伏羲听其妹女娲说过，这回大战可谓是必须胜的，巫妖两族气运相当，这一战，谁胜谁败将决定谁能主宰天地两界。于是伏羲非常卖命，万恐自己妖族失利。使出伏羲琴弹出千古绝唱，群魔乱舞。巫族不敌，纷纷溃退。眼看巫族的帝江支持不住了，伏羲高兴极了，竟大笑起来，不料却没注意手中之琴。一下弹断了数根琴弦，这伏羲琴一破，帝江马上上前，手中法宝一闪，伏羲却是被打落在地，鲜血狂吐，却是被打死了。